1、医药行业税务合规报告（医药行业税务合规报告（2025）前 言前 言医药行业税务风险与商业贿赂问题息息相关，呈现出虚开与商业贿赂并存的特点，具有明显的行业特征。2024 年，国家卫健委、药监局、市监局等多部门研究出台预防和打击医药行业商业贿赂问题的政策文件，持续查处医药行业“带金销售”等违法违规行为，十四部委联合继续纠正医药购销不正之风，证交所和证监会重点关注上市药企销售费用占比的合理性和发票的合规性。随着国家对医药行业商业贿赂问题整治力度不断升级，税务部门对医药企业涉税违法行为力度也持续加码，2024 年爆发了多起医药企业虚开大案、偷逃税要案，引发医药企业补缴增值税税款、缴纳滞纳金、纳税调整和

2、罚款等一系列税务风险，部分企业还被追究虚开犯罪的刑事责任。医药企业事前如何做好税务合规，防范潜在的涉税风险，事后如何有效举证和抗辩，应对已爆发的涉税风险，成为医药行业亟需关注和解决的问题。华税团队基于对医药行业的深入观察，编写了本医药行业税务合规报告（2025）。此报告通过观察 2024 年医药行业发展概况及税收监管动态，聚焦2024 年医药行业涉税刑事、行政案件并总结 2024 年医药行业涉税风险的表现形式，解析 2024 年医药行业虚开风险的成因，并在前述的基础上提出化解与应对涉税风险的建议，确保建议的精准性、针对性、实效性，以期为医药行业的税务合规建设与发展提供有益的启示与参考。本报告共

3、分八节，全文约二万三千余字。目 录目 录一、2024 年医药行业发展概况二、2024 年医药行业税收监管动态三、2024 年医药行业涉税案件观察四、2024 年医药行业涉税风险的六大表现形式五、医药行业虚开风险的成因分析六、医药行业涉税刑事风险的应对与化解七、医药行业涉税行政风险的应对与化解八、2025 年医药行业税务合规的建议第 1 页 共 35 页一、一、2024 年医药行业发展概况（一）疫情后制药企业业绩呈现下降趋势，现已趋于平稳年医药行业发展概况（一）疫情后制药企业业绩呈现下降趋势，现已趋于平稳根据国家统计局数据，全国规模以上制药企业 2020 年 1 月-11 月营业收入处于近五年最

4、低水平，2021 年 1 月-11 月营业收入和利润总额达到了顶峰，而后呈现下降趋势，现已趋于平稳。具体来说：从营业收入的数据来看，2021 年较 2020 年上升 18.59%；2022 年较 2021 年下降 0.73%；2023 年较 2022 年下降 13.09%；2024 年较 2023 年上升 0.53%；从利润总额的数据来看，2021 年较 2020 年上升 71.78%；2022 年较 2021 年下降28.15%；2023 年较 2022 年下降 19.39%；2024 年较 2023 年下降 2.52%。这与行业的宏观环境变化密不可分。2020 年受疫情影响，制药企业物流成

5、本上升，导致营业收入和利润总额的表现不佳；2021 年全国对疫苗、药品等需求的激增，使得制药企业迎来高速发展，营业收入和利润总额均创下近五年新高。2022 年至 2024 年期间，国家先后发布关于做好国家组织药品集中带量采购协议期满后接续工作的通知 药品上市许可持有人委托生产监督管理工作药品标准管理办法等文件，强化药品监管力度，同时持续打击医药行业商业贿赂，导致制药企业营业收入和利润总额呈现大幅下降趋势，尤其 2023 年 7 月，全国开展医药领域腐败问题集中整治工作，2023 年营业收入和利润总额下降的幅度较大，至 2024 年趋于平稳。（二）国家多部门发布医药行业政策文件，重点打击商业贿赂

6、问题（二）国家多部门发布医药行业政策文件，重点打击商业贿赂问题第 2 页 共 35 页1.十四部委联合继续纠正医药购销领域不正之风十四部委联合继续纠正医药购销领域不正之风2024 年 5 月 27 日，卫健委、国家税务总局等十四部委联合印发了2024年纠正医药购销领域和医疗服务中不正之风工作要点的通知。“纠正医药购销领域和医疗服务中不正之风”是卫健委联合税务、公安、审计、市场监管等多部门长期共同开展的专项整治活动，旨在深入协同推进医药购销领域制度建设。工作要点 指出，加大医药购销领域商业贿赂治理力度，聚焦虚开发票、虚假交易、虚设活动等形式违规套取资金用于实施不法行为，保持打击高压态势。严查假借